Secara umum, bagian mikroskopik dibagi dalam dua kelompok, yakni bagian optik dan bagian non optik atau mekanik.
Bagian Optik
- Lensa okuler, fungsinya memperbesar kembali bayangan dari lensa objektif. Perbesarannya biasanya 6, 10 atau 12 kali. Di sinilah kita meletakkan mata untuk mengamati objek.
- Lensa objektif, fungsinya memperbesar bayangan objek/benda. Untuk perbesarannya 10, 40, atau 100 kali dan biasanya terdapat 3 lensa.
- Diafragma, fungsinya mengatur banyak sedikitnya cahaya yang masuk ke lensa objektif. Fungsinya sama dengan pupil yang ada pada mata manusia.
- Cermin, fungsinya untuk mengarahkan cahaya pada objek.
Bagian-Bagian Mekanik
- Lengan mikroskop, fungsinya sebagai pegangan untuk memindahkan benda atau membawa mikroskop.
- Tabung mikroskop, bagian mikroskop yang menghubungkan antara lengan okuler dengan lensa objektif.
- Kondensor, fungsinya mengumpulkan cahaya yang masuk.
- Revolver, fungsinya untuk mengatur perbesaran lensa objektif yang diinginkan.
- Makrometer (pemutar kasar), fungsinya menaikkan atau menurunkan tabung secara cepat.
- Mikrometer (pemutar halus), fungsinya menaikkan dan menurunkan tabung secara lambat.
- Meja benda (meja preparat), fungsinya sebagai tempat untuk meletakkan preparat dan objek yang akan diamati.
- Penjepit objek, berfungsi untuk menjepit preparat yang akan diamati dan agar tidak bergeser.
- Kaki mikroskop, fungsinya sebagai penyangga mikroskop.